Bioinformatiker - Humangenetik, Molekulargenetik, NGS (m/w/d)

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Job description

Im Fachbereich Humangenetik Molekulargenetik NGS, Standort Campus Virchow-Klinikum (CVK) besetzen wir ab sofort eine Position als

Bioinformatiker (m/w/d)
(Kennziffer: 14066)

Labor Berlin wurde zum 1. Januar 2011 als Tochterunternehmen der Charité - Universitätsmedizin Berlin und Vivantes Netzwerk für Gesundheit GmbH gegründet und versorgt mit über 600 Mitarbeiterinnen und Mitarbeitern an elf Standorten mehr als 25.000 Krankenhausbetten in Berlin und dem gesamten Bundesgebiet mit qualitativ hochwertiger medizinischer Diagnostik. Dabei werden pro Jahr mehr als 40 Millionen Laboranalysen durchgeführt. Das damit größte Krankenhauslabor Europas vereinigt von der Klinischen Chemie über die Mikrobiologie und Virologie bis hin zur speziellen endokrinologischen, immunologischen und genetischen Diagnostik alle Fachdisziplinen der Labormedizin und bietet daher in der Einheit mit den wissenschaftlichen Instituten der Charité völlig neue Möglichkeiten für die Versorgung von Patientinnen und Patienten sowie in der Weiterentwicklung der medizinischen Diagnostik.
Betreuung der Nächste Generation Sequenzierung (NGS)-basierten Humangenetischen Diagnostik
Bearbeitung klinisch-diagnostischer Fragestellungen in enger Zusammenarbeit mit dem Fachbereich Humangenetik (Prof. Dr. Stefan Mundlos)
Betreuung und Weiterentwicklung einer Datenbanklösung für genomischen Varianten und Phänotypinformationen
Betreuung von NGS Analyse-Workflows zur standardisierten Auswertung von Sequenzierinformationen in Fachbereichen Humangenetik & Hämatologie
Organisation relevanter Software Tools sowie Automatisierungslösungen
Definition und Überprüfung von Leistungseckpunkten zur Gewährleistung der NGS-Sequenzierung nach QM-Standards, Akkreditierung und IVD-R

abgeschlossenes Hochschulstudium der Bioinformatik, Informatik oder vergleichbare Qualifikation
mehrjährige & praktische Erfahrungen in der Analyse von NGS Daten
sehr gute Deutsch- und Englischkenntnisse (Deutsch verhandlungssicher (bzw. C1/C2 Niveau))
gute Programmierkenntnisse in Bash und Python (Erfahrungen in R, C++, Java und Web-Programmierung erwünscht)
erste Erfahrungen mit Workflow Management Systemen (wie Snakemake)
Erfahrungen in Datenvisualisierungsframeworks wie R Markdown, R Shiny, Jupyter Notebook
Kenntnisse zur standardisierten Implementierung von Medizinprodukte-Software nach IVD-R und ISO 15189 erwünscht
Kenntnisse von Linux Cluster Architekturen, bioinformatischer Algorithmik und Sequenzanalyse erwünscht
Verständnis für Molekulardiagnostischen Methoden
überdurchschnittliche Motivation und Flexibilität
hohe Teamfähigkeit und gute Kommunikation im interdisziplinären Team

Es erwartet Sie eine abwechslungsreiche und herausfordernde unbefristete Tätigkeit mit 40 Wochenstunden
Wir bieten Ihnen ein interessantes Arbeitsfeld mit exzellenten Entwicklungsmöglichkeiten auch in anderen Gebieten der Laboratoriumsdiagnostik, eine fachlich sehr fundierte Einarbeitung und ein sozial geprägtes Arbeitsumfeld
Eine attraktive Vergütung unter Berücksichtigung Ihrer persönlichen Voraussetzungen
Individuelle Entwicklungsmöglichkeiten und Teilnahme an unserem umfassenden Fort- und Weiterbildungsprogramm mit über 90 Veranstaltungen im Jahr
Mitgliedschaft in über 200 Sportstätten in Berlin und Umgebung über den Urban Sports Club
Notfallbetreuung Ihres Kindes über „Kids Mobil"
Möglichkeit eines kostenlosen labordiagnostischen Basis-Checks alle 2 Jahre
Aktives Ideenmanagement und Unterstützung bei der Verwirklichung Ihrer Projekte und Ideen
Eine Vielzahl an tollen Veranstaltungen ausgerichtet für unsere Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter, z.B. Sommerfest, Weihnachtsfeier, Sportevents, Gesundheitstag
Weitere attraktive Arbeitgeberleistungen rund um Ihre persönlichen Bedürfnisse, wie z.B. Altersvorsorge und Berufsunfähigkeitsversicherung